El Museo de Historia Natural de la Universidad Distrital Francisco José de Caldas (MHNUD), adscrito a la Facultad de Ciencias Matemáticas y Naturales, es una unidad académica dedicada a la preservación, documentación y estudio de colecciones científicas de vertebrados, con un enfoque en la biodiversidad andina colombiana. Su origen se remonta al año 2000 como iniciativa del Grupo de Investigación Biodiversidad de Alta Montaña, al cual continúa vinculado. Fue este grupo quien, en el marco de sus primeras investigaciones en ecosistemas altoandinos, recolectó el primer ejemplar que dio origen a las colecciones del museo, sentando así las bases para su consolidación institucional.

Actualmente, el MHNUD alberga tres colecciones científicas principales: mastozoología, herpetología y ornitología, que reúnen especímenes provenientes de 384 expediciones de campo realizadas en 19 departamentos de Colombia, cubriendo más de 179 localidades en 125 municipios. A estas se suman una colección de huellas en yeso de mamíferos, un banco de tejidos para análisis genéticos, y una colección de micropreparados de estructuras pilosas, desarrollada en colaboración con el Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia.

Las colecciones del MHNUD están abiertas a la consulta de investigadores nacionales e internacionales, así como de instituciones educativas, grupos comunitarios, organizaciones ambientales y entidades interesadas en el conocimiento y conservación de la biodiversidad. Su sede actual se encuentra en la Macarena B de la Universidad Distrital, en el primer nivel de los laboratorios de Biología.

Más de 200 personas entre investigadores, estudiantes y colaboradores han contribuido a la consolidación del museo, con el apoyo fundamental de comunidades rurales e indígenas, así como de instituciones aliadas como Corpoamazonia, la CAM y diversas organizaciones no gubernamentales. Los ejemplares que conforman las colecciones provienen de tesis de grado, proyectos institucionales, convenios de cooperación, investigaciones docentes, donaciones comunitarias y rescates de fauna en carreteras y otros entornos.

El MHNUD representa hoy el compromiso de la Universidad Distrital con la ciencia, la formación académica y la conservación del patrimonio natural colombiano, consolidándose como un referente universitario en el estudio de la biodiversidad de vertebrados. A través de sus colecciones y actividades, el museo también expresa el compromiso de contribuir a la actualización del inventario de la biodiversidad del país —especialmente en regiones menos exploradas y en ecosistemas de alta montaña—, así como a la comprensión de la distribución espacial de la diversidad biológica. Este conocimiento, que hoy es reconocido como parte del patrimonio natural nacional, se preserva y documenta en el museo como legado para la ciencia y la sociedad.